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* 通讯作者：Jinbo Xu, jinboxu@moleculemind.com 参考文献 [1] Joseph L Watson, David Juergens, Nathaniel R Bennett, Brian L Trippe, Jason Yim, Helen E Eisenach, Woody Ahern, Andrew J Borst, Robert J Ragotte, Lukas F Milles, et al. De novo design of protein structure and function with rfdiffusion. Nature, 620 (7976):1089–1100, 2023. [2] Martin Pacesa, Lennart Nickel, Christian Schellhaas, Joseph Schmidt, Ekaterina Pyatova, Lucas Kissling, Patrick Barendse, Jagrity Choudhury, Srajan Kapoor, Ana Alcaraz-Serna, et al. One-shot design of functional protein binders with bindcraft. Nature, 646 (8084):483–492, 2025. [3] Vinicius Zambaldi, David La, Alexander E Chu, Harshnira Patani, Amy E Danson, Tristan OC Kwan, Thomas Frerix, Rosalia G Schneider, David Saxton, Ashok Thillaisundaram, et al. De novo design of high-affinity protein binders with alphaproteo. arXiv preprint arXiv:2409.08022, 2024. [4] Chai Discovery Team, Jacques Boitreaud, Jack Dent, Danny Geisz, Matthew McPartlon, Joshua Meier, Zhuoran Qiao, Alex Rogozhnikov, Nathan Rollins, Paul Wollenhaupt, et al. Zero-shot antibody design in a 24-well plate. bioRxiv, pages 2025–07, 2025. [5] Luis S Mille-Fragoso, John N Wang, Claudia L Driscoll, Haoyu Dai, Talal Widatalla, Xiaowei Zhang, Brian L Hie, and Xiaojing J Gao. Efficient generation of epitope-targeted de novo antibodies with germinal. bioRxiv, 2025. [6] Hannes Stark, Felix Faltings, Min Gyu Choi, Yuxin Xie, Eunsu Hur, Timothy O’Donnell, Anton Bushuiev, Talip Uçar, Saro Passaro, Weian Mao, et al. Boltzgen: Toward universal binder design. bioRxiv, pages 2025–11, 2025. [7] BioGeometry Team and Jian Tang. Rapid de novo antibody design with geoflow-v3. bioRxiv, pages 2025–10, 2025. [8] Sheng Xu, Qiantai Feng, Lifeng Qiao, Hao Wu, Tao Shen, Yu Cheng, Shuangjia Zheng, and Siqi Sun. Foldbench: An all-atom benchmark for biomolecular structure prediction. bioRxiv, pages 2025–05, 2025. [9] Josh Abramson, Jonas Adler, Jack Dunger, Richard Evans, Tim Green, Alexander Pritzel, Olaf Ronneberger, Lindsay Willmore, Andrew J Ballard, Joshua Bambrick, et al. Accurate structure prediction of biomolecular interactions with alphafold 3. Nature, 630 (8016):493–500, 2024. [10] Helen M Berman, John Westbrook, Zukang Feng, Gary Gilliland, Talapady N Bhat, Helge Weissig, Ilya N Shindyalov, and Philip E Bourne. The protein data bank. Nucleic Acids Research, 28 (1):235–242, 2000. [11] Claudio Mirabello and Björn Wallner. Dockq v2: improved automatic quality measure for protein multimers, nucleic acids, and small molecules. Bioinformatics, 40 (10):btae586, 2024. [12] Saro Passaro, Gabriele Corso, Jeremy Wohlwend, Mateo Reveiz, S. Thaler, Vignesh Ram Somnath, Noah Getz, Tally Portnoi, J. Roy, Hannes Stark, D. Kwabi-Addo, Dominique Beaini, Tommi Jaakkola, and Regina Barzilay. Boltz-2: Towards accurate and efficient binding affinity prediction. bioRxiv, pages 2025–06, 2025. [13] ByteDance Seed. Protenix-v2: Broadening the reach of structure prediction and biomolecular design. 2025. [14] ByteDance AML AI4Science Team, Xinshi Chen, Yuxuan Zhang, Chan Lu, Wenzhi Ma, Jiaqi Guan, Chengyue Gong, et al. Protenix—advancing structure prediction through a comprehensive alphafold 3 reproduction. bioRxiv, pages 2025–01, 2025. [15] Salvatore Candido et al. Language modeling materializes a world model of protein biology, 2026. URL https://github.com/biohub/esm. Biohub preprint. [16] Ivan Anishchenko, Samuel J Pellock, Tamuka M Chidyausiku, Theresa A Ramelot, Sergey Ovchinnikov, Jingzhou Hao, Khushboo Bafna, Christoffer Norn, Alex Kang, Asim K Bera, et al. De novo protein design by deep network hallucination. Nature, 600 (7889):547–552, 2021. 附录 A 设计 VHH 序列针对已知抗体数据库的 CDR 相似性分析 为评估设计序列相对于已知抗体序列的新颖性，我们对 338 个 VHH 序列进行了 CDR 相似性分析，涵盖 11 个靶标系统，并额外检查了每个系统中亲和力最高的 VHH 候选物。

9、7月9日上午！国乒传来3大名将，马龙、王楚钦、孙颖莎的消息

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1、如果夺冠+金靴全拿，C罗能赚多少？1.78亿年薪+股份，沙特赚了吗

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3、4支球队接触！山东泰山大将德尔加多加盟新东家，成今夏离队第3人

恶臭恶臭，就像个“粪水池”，这日子还怎么过？！ 电梯基坑 满是粪水 帮忙君实地探访。前有梅西后有亚马尔，中生代还有哈兰德，姆巴佩终生难获金球？闪电新闻记者 韩继鸿 李亚宣 报道齐鲁网·闪电新闻7月24日讯25号，黄海北部将有0.5-1.0m的轻浪,浪向南；黄海中部将有1.0-1.5m的轻浪到中浪,浪向南；渤海将有0.5-1.0m的轻浪,浪向南。

4、陈吉宁龚正等市领导深入基层，走访慰问坚守岗位持续奋战的一线劳动者

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5、又一“零食界的山姆”，落地无锡！

复旦大学校长、中国科学院院士金力，复旦大学学术委员会主任、中国科学院院士龚新高，复旦大学校长助理、上智院理事长吴力波，复旦大学复杂体系多尺度研究院院长马剑鹏，上智院院长、复旦大学特聘教授漆远，上海人工智能实验室主任助理、领军科学家乔宇，上海祖泉创新转化研究院院长、复旦科创董事长孙彭军，上海未来产业基金总经理、上海未来启点社区理事长魏凡杰，复旦大学数学科学学院研究员任潇，复旦大学研究员、上智院 AI 科学家屈超，共同发布挑战赛 为保障赛事的专业性与权威性，该赛道特别组建了由多位在 CNS 级科研成果领域具有广泛影响力的院士和顶尖学者组成的评审委员会。

6、19点48分！北京国安官宣京沪大战延期，补赛时间基本确定 又遇难题

陈敏尔、张工感谢队员们的辛勤付出，希望大家保持战备状态，提升应急处置和平急转换能力，做到召之即来、来之能战、战之能胜。

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8、阿根廷全场2脚射门！1分钟2次错失绝平，0-1后梅西痛失冠军+金靴

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